Introducción: El virus de la hepatitis E (VHE) es un patógeno de importancia creciente en salud pública, es trasmitido por vía fecal-oral y estudios recientes avalan el comportamiento zoonótico de esta entidad, siendo el cerdo el principal reservorio. Objetivos: determinar la prevalencia del VHE en individuos que laboran en granjas de cerdos e identificar la variabilidad nucleotídica de los aislamientos del VHE. Materiales y Métodos: Se estudiaron 106 trabajadores y se definieron dos grupos, 69 empleados que estaban relacionados con cerdos y 37 que no tenían contacto con los cerdos. Las muestras de suero fueron analizados para la presencia de Ig totales anti-VHE. Las muestras de heces fueron obtenidas de 57 obreros y 53 cerdos. Todas las heces fueron analizadas para ARN-VHE mediante RT-PCR. Los productos de amplificados fueron secuenciados y analizados filogenéticamente. Resultados: Un total de 38 (35.8%) sueros fueron positivos para anti-VHE. La positividad fue mayor en las personas que trabajaban en contacto con los cerdos, comparado con individuos cuyas ocupaciones no estaban en contacto con estos animales (40% vs 27%, respectivamente). La prevalencia de anti-VHE fue elevada en trabajadores con rango de edad de 60–70 años y tiempo de trabajo 10–13 años. El ARN-VHE fue detectado en 14% de las heces humanas y 18.8% de heces de cerdos. El análisis filogenético de las secuencias de VHE humanas y de cerdos demostró que tenían 94–99% de homología nucleotídica y pertenecían al genotipo 3. Conclusión: La infección por el VHE constituye una zoonosis en nuestro medio.